2024 SGO口头报告：世和基因子宫内膜癌早筛模型敏感性达96.4%

子宫内膜癌（Uterine corpus endometrial carcinoma，UCEC）是妇科常见癌种。临床实践中，UCEC的发现主要基于妇科超声检查及宫腔镜有创检查，被检者往往依从性不佳。UCEC目前尚缺乏标准筛查手段，无法做到“早发现，早干预”，间接导致20%到30%的UCEC患者在初诊时已进入中晚期。液体活检是近几年新兴的筛查方式，其在UCEC中性能如何呢？

2024年第55届美国妇科肿瘤学会（SGO）妇科肿瘤年会上，福建省肿瘤医院徐沁教授团队与世和基因合作的基于cfDNA片段组学技术的子宫内膜癌早筛研究入选口头报告。该研究基于三种cfDNA片段组学特征构建的早筛模型对I期UCEC表现出了96.4%的敏感性，并首次证实了片段组学技术用于子宫内膜癌早期筛查的可行性，为妇科肿瘤的早期筛查提供了新思路和新方法。

Early detection of uterine corpus endometrial carcinoma utilizing plasma cfDNA fragmentomics

合作单位：福建省肿瘤医院徐沁教授团队

报告时间：北京时间3月18日00:45-01:45

研究内容

1. UCEC队列设计严谨

研究入组了共240例受试者（包括UCEC和健康人）的外周血样本。以2021年8月至2022年9月的入组患者作为训练集，2022年11月至2023年2月入组的患者为独立验证集（图1），47例子宫肌瘤患者为特异性验证集。该研究基于“世和早筛样本管理系统”进行收样和信息管理。样本采集条件一致性较好，临床信息管理完善。

图 1. 片段组学用于UCEC筛查的队列设计

2. 片段组学特征可反映UCEC生物学信号

研究采用WGS全基因组测序技术并分析了三种片段组学特征，拷贝数变异（Copy number variation，CNV）、核小体印记（Nucleosome footprint，NF）和片段分布（Fragment size distribution，FSD）。CNV特征中，UCEC存在文献报道一致的Chr1.q扩增；NF特征中，UCEC差异表达的转录因子富集在癌症和免疫相关的通路中；FSD特征中，UCEC短片段分布比例高的染色体如Chr1,10,6,11,17等也是UCEC高频突变区域（图2）。

图 2. UCEC和健康人FSD片段分布差异

3. 片段组学用于UCEC早筛的性能优异

模型在验证集中的AUC为0.994，在95.5%特异性下敏感性为97.8%（图3），I期敏感性为96.4%，II到IV期敏感性100%。临床病理分期和得分有正相关趋势，晚期样本的肿瘤丰度更高，得分也更高。此外模型也可对子宫肌瘤患者实现较好的排除，特异性达91.5%。

图 3. 验证集中模型的性能

结语

本研究通过严谨的队列设计和完善的样本库管理系统实现了小样本量UCEC单中心早筛研究。运用目前较为灵敏的片段组学技术实现了UCEC较高的早筛性能，为妇科肿瘤早期筛查提供了新方法，也为其他缺少标准筛查手段的癌种提供了新思路。

作者：Glu   审核：简爱  排版：Moro

<<<  上下滑动查看 >>>

世和基因致力于高通量测序技术的临床转化应用，为肿瘤精准医疗提供分子诊断服务和产品，并为医院提供一站式NGS解决方案

NGS及液体活检实验室获CAP / CLIA / ISO15189三重国际认证，249次通过国家卫健委临检中心室间质评

公司核心技术团队参与发表SCI论文超610篇，总影响因子(IF)超4500分；2020年度江苏省科学技术二等奖：“肺癌精准医学高通量测序检测技术的创新与产业化”项目；拥有发明专利58项（其中境内55项）

2018年，公司研发的益胜康™“EGFR / ALK / ROS1 / BRAF / KRAS / HER2基因突变检测试剂盒（可逆末端终止测序法）”获得国家药监局注册审批，系国内同期首批获准上市的肿瘤伴随诊断高通量基因检测产品之一

2023年，公司研发的世和一号^®NGS大Panel TMB试剂盒获得国家药监局创新审批上市，是国内肿瘤基因检测行业的首个NGS大Panel体外诊断产品

基于ATG-Seq等液体活检技术的CALIBRATE系列多癌种围术期大型临床研究成果相继发表。2021年5月，前瞻性多中心早中期肠癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-CRC）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年9月，液体活检预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于PLoS Med（IF=15.8）；2021年11月，前瞻性早中期肺癌术后ctDNA MRD大型临床研究（CALIBRATE-NSCLC）成果发表于Nature Comms（IF=16.6）；2022年5月，ctDNA预测局晚期NSCLC精准放化疗疗效大型临床研究（CALIBRATE-LC/EC-CRT）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年10月，前瞻性早中期肺癌术后MRD ctDNA克隆分析大型研究（CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2023年10月，前瞻性早中期胃癌MRD队列研究（CALIBRATE-GC）成果发表于Cancer Commun（IF=16.2）。此外，世和正将MERCURY技术应用于多项MRD研究。2022年10月，基于MERCURY多组学技术预测直肠癌新辅疗效的大型临床研究（M-CALIBRATE-RC-nCRT）成果发表于Clin Chem（IF=9.2）；2023年5月，基于MERCURY多组学技术预测NSCLC术后复发风险的前瞻性大型临床研究（M-CALIBRATE-LuCaTH）成果发表于Cancer Res Comms

基于MERCURY多组学液体活检技术的DECIPHER系列多癌种早筛研究成果相继发表。2021年10月，大型肠癌早筛临床研究（DECIPHER-Colon）成果发表于J Hematol Oncol（IF=28.5）；2021年12月，大型肝癌早筛临床研究（DECIPHER-Liver）成果发表于Hepatology（IF=13.5）；2022年6月，国内首个大型泛癌种早筛研究（DECIPHER-Multi）成果发表于Mol Cancer（IF=37.3）；2022年6月，国内首个基于cfDNA Motif特征的肺癌早筛大型临床研究（DECIPHER-Lung）成果发表于eBioMedicine（IF=11.1）；2022年11月，大型肺癌早筛临床研究（DECIPHER-Lung 2）成果发表于Am J Respir Crit Care Med（IF=24.7）